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1936年9月，国立药学专科学校创校。1950年6月，更名华东药学专科学校。1952年11月，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入，成立华东药学院。1953年，武汉中南卫生专科学校药剂专科班并入。1956年6月，更名南京药学院。1986年10月，与南京中药学院合并，成立中国药科大学。2001年，江苏省药科学校并入。2015年，南京鼓楼医院成为中国药科大学临床学院,南京市第一医院加盟。

有玄武门、江宁2个校区。有16个学院，31个本科专业。有国家一级重点学科1个，药学。王牌专业：药学、药物制剂、中药学。

有中国工程院院士2人，外籍院士1人。

　　知名校友：叶桔泉、徐国钧等。

　　地址：江苏省南京市童家巷24号
　　网址：http://www.cpu.edu.cn/
　　乘车路线：南京火车站乘南广线或南金线到江宁商城、府前路、竹山桥中的任一站,转公交通盛线，到终点站药科大学江宁校区东门下。

　　校训：精业济群
　　精业济群原为国立药学专科学校校训，中国药科大学曾改校训为"严谨、求实、团结、创新"，2006年70周年校庆之际，恢复原校训。
　　精业者，专注也，将制药作为终身的事业，精勤笃行、一以贯之，方可达到济世救群的最终目标。

　　校徽：图案主体由三个苯环、一个人组成。苯环意为制药方法，核心是一个人，寓意以人为本的制药、教学精神。人形图案形似字母Y，与药字拼音首字母相同，代指药科特色、药科大学。